Растение достигает в высоту до 50 см. Луковица имеет продолговато-яйцевидную форму, достигает в ширину (0,6) 0,8–1,2 см и может расти как одиночно, так и группами по 2–3 (5) штук на коротком корневище. Шнитт-лук имеет хорошо развитую мочковатую корневую систему, причем у каждого отдельного отростка собственное корневище. Корни уходят вглубь почвы на тридцать сантиметров, редко на восемьдесят, переплетаются между собой и корнями других растений (в результате образовывается дернина). В июле месяце корни начинают постепенно восстанавливаться, старые отмирают на момент появления молодых. Стебель растения дудчатый и гладкий. Листья представлены в количестве 1–2 штук, они также имеют дудчатую форму и достигают в ширину (1,5) 4–5 мм. Соцветие представляет собой густоцветковую полусферу или шар диаметром (2) 3–4 см.
